Les 15 Meilleurs Logiciels de Facturation en Ligne en 2025 : Le Comparatif Complet

Dernière mise à jour le 13/05/2025

Quel est le meilleur logiciel de facturation en ligne ? C’est celui qui correspond à votre entreprise et vos besoins. Comparer les nombreux outils de facturation est tout sauf une partie de plaisir (on confirme). On l’a fait pour vous.

Pour vous proposer le comparatif des logiciels de devis facture le plus complet et transparent en 2025, nous avons passé plus de 128 heures à tester, analyser et comparer 15 logiciels de facturation et récolté plus de 1250 retours clients.

Notre objectif ? Vous aider à faire le bon choix de logiciel de facturation rapidement et facilement. Vous cherchez le logiciel de facturation idéal ? Suivez le guide !

En bref :

Si vous avez la flemme de parcourir notre comparatif détaillé, voici nos recommandations ❤️ :

• Pennylane pour le professionnels qui cherchent le logiciel de facturation le plus complet ;
• Abby pour les microentrepreneurs ;
• Indy pour les professionnels qui cherchent le meilleur logiciel de facturation gratuit ;
• Evoliz et Axonaut pour les TPE qui cherchent un outil tout-en-un (facturation, pré-comptabilité, gestion) avec un bon rapport qualité/prix.

Notre comparatif logiciel de facturation regroupe uniquement des solutions de qualité. Notre sélection : Pennylane, Abby, Indy, Evoliz, Axonaut, Freebe, Costructor, Tolteck, Henrri, Zervant, Obat, Macompta et Factomos.

Analyser, comparer, tester et échanger avec les utilisateurs des logiciels de facturation prend du temps. Il existe d’autres logiciels qui ne sont pas encore présents dans notre comparatif mais qui méritent d’être mentionnés.

On pense notamment à Sellsy, qui propose un module de facturation au sein de son ERP, à Tiime, NeedMe, Gestan et INFast.

Pennylane est le logiciel de comptabilité que nous recommandons le plus et le leader du marché de la comptabilité en France. La startup française a eu la bonne idée d’inclure son logiciel de facturation dans ses premiers abonnements ce qui permet de rendre son logiciel accessible aux professionnels qui cherchent un logiciel de facturation en ligne.

Design, fonctionnalités, service client, intégration… Tout y est ! Seuls bémol, son prix :à partir de 14€/mois pour les indépendants et à partir de 29€/mois pour les TPE, qui sera peut-être trop élevé pour les micro-entrepreneurs et indépendants. Si vous cherchez le meilleur logiciel de facturation, nous ne pouvons que vous recommander Pennylane.

À l’instar de Pennylane, Abby s’est rapidement imposé comme le leader du marché sur son segment : les microentrepreneurs. C’est le logiciel de facturation en ligne que nous recommandons le plus pour ce profil grâce à un logiciel très bien pensé et de nombreuses fonctionnalités :

• Édition de devis et facture ;
• Déclaration ;
• Comptabilité ;
• Pilotage ;
• Compatible API tiers de prestation.

Le logiciel de facturation évolue très vite et propose régulièrement de nouvelles fonctionnalités. Cerise sur le gâteau : une satisfaction client largement au-dessus de la moyenne. Attention tout de même, il faudra vous passer d’Abby si vous transformez votre microentreprise en société.

Le logiciel de comptabilité Indy fait une arrivée remarquée dans notre comparatif 2025 des logiciels de facturation grâce à son offre 100% gratuite qui vient bouleverser le marché. À ce prix-là on pourrait s’attendre à un logiciel « au rabais » mais c’est mal connaître Indy qui propose toutes les fonctionnalités suivantes gratuitement :

• Création et personnalisation de devis et factures ;
• Suivi des paiements en temps réel ;
• Association automatique des factures et des paiements.

Quand on sait qu’Indy propose également un compte pro gratuit, le logiciel a tout pour séduire les néo-entrepreneurs d’autant plus qu’Indy reproduit les recettes du succès de son logiciel de comptabilité sur son offre gratuite : design réussi, facilité d’utilisation et support client réactif.

Mais pourquoi Indy est-il aussi généreux ? Son logiciel de facturation gratuit est une formidable vitrine pour son logiciel de comptabilité qui est payant.

Evoliz est un logiciel français de facturation, gestion et pré comptabilité français. Très complet, le logiciel est une véritable « boîte à outils » avec différents modules :

• Facturation ;
• Comptabilité ;
• Gestion commerciale ;
• Gestion fournisseur ;
• Pilotage.

Le logiciel s’adresse aux dirigeants de TPE/PME et cabinets d’expertise-comptable et se différencie avec de nombreuses possibilités de personnalisation et sa certification NF203 et NF525.

Avec toutes ces fonctionnalités, Evoliz est plus certes cher que la moyenne du marché (à partir de 20€/mois)mais moins cher que ses concurrents directs que nous vous présentons plus tard. Dernier point à souligner chez Evoliz : la satisfaction client, largement au-dessus de la moyenne du marché.

Sur le même segment « logiciel tout-en-un » qu’Evoliz, Axonaut est mieux noté sur la partie CRM dans notre analyse et propose plus de fonctionnalités.

Le logiciel est plus polyvalent selon nous et répond aussi bien aux besoins des TPE et PME en couvrant l’ensemble des besoins des petites et moyennes entreprises :

• Édition de devis et facture ;
• Facturation récurrentes ;
• CRM ;
• Facture électronique ;
• Gestion des achats/des dépenses ;
• Notes de frais ;
• Pré-comptabilité ;
• Ressources humaines ;
• Ticketing ;
• Gestion de projet.

Axonaut propose aussi des modules marketing et gestion des stocks mais ils sont plutôt limités. Pourquoi avons-nous placé Axonaut après Evoliz dans notre analyse ? Le logiciel est plus cher mais cela ne nous empêche pas de le recommander quand on voit toutes les fonctionnalités. Axonaut remplace, pour les besoins les plus simples, de nombreux logiciels.

Chez Tool Advisor, on aime les logiciels hyper-spécialisés. On est servi avec Freebe qui est un logiciel de gestion à destination des freelances et des freelances en microentreprise uniquement. Le logiciel est pensé pour ce profil et il concurrence directement un logiciel plus polyvalent comme Abby sur ce segment. Il suffit de regarder les fonctionnalités, en plus de l’édition classique de devis et facture, Freebe propose :

• Le suivi de vos temps ;
• La synchronisation bancaire ;
• Un tableau de bord complet ;
• La déclaration de votre chiffre d’affaires ;
• Les paiements directement depuis Freebe ;
• Une application mobile.

Ajoutez à ces fonctionnalités la qualité du support client et des prix très compétitifs, Freebe est à ajouter dans votre benchmark si vous êtes freelance.

De nombreux logiciels non-spécialistes proposent un logiciel de facturation incorporés. C’est le cas du leader du compte pro en ligne Qonto. Le logiciel de facturation de Qonto est accessible gratuitement même si vous n’êtes pas client de Qonto pour votre compte pro. Les fonctionnalités essentielles sont présentes :

• Création de devis et factures en illimité ;
• Catalogue de produits et services ;
• Multi-devises ;
• Gestion des notes de frais ;
• Gestion automatisée des factures ;
• Logiciel conforme à la facturation électronique ;
• Tableau de bord ;
• Factures clients et fournisseurs.

Qonto communique assez peu sur son logiciel de facturation malgré ses qualités. Le logiciel s’adresses à tous les profils de professionnels mais on le conseille aux entrepreneurs qui ont des besoins simples même si vous n’êtes pas clients chez Qonto.

Quel chemin parcouru par Costructor depuis son lancement en 2022 ! Sur un marché saturé, le logiciel de facturation pour les artisans du bâtiment, Costructor a su se faire une place de choix et séduire plus de 25 000 utilisateurs en moins de 2 ans grâce à un logiciel très simple d’utilisation, des prix très compétitifs et des fonctionnalités dédiées aux professionnels du bâtiment :

• La bibliothèque d’ouvrage ;
• Le suivi de chantier ;
• L’intégration avec Batiprix.

On apprécie également la signature électronique et la possibilité de payer directement depuis le logiciel. Il existe de nombreux (bons) logiciels de facturation pour les artisans du bâtiment, Costructor s’est rapidement mis au niveau pour les fonctionnalités et gagne des parts de marché grâce à son design et son accompagnement.

Concurrent direct de Costructor, il faut être honnête, c’est très difficile pour nous de les départager. Costructor est mieux noté dans notre analyse sur le design et les prix (un élément incontournable pour nos visiteurs, on vous connait bien) mais sur les fonctionnalités, léger avantage pour Tolteck.

On apprécie particulièrement le (vrai) mode hors-ligne souvent absent chez ses concurrents et la bibliothèque d’ouvrage.

Tolteck est une valeur sûre : satisfaction client, facilité d’utilisation et prix compétitif.

Sellsy est un CRM/ERP français avec des modules facturation, pré-comptabilité et trésorerie. Le module de facturation seul de Sellsy est cher mais il est très intéressant avec l’offre tout-en-un du CRM. On le conseille donc seulement si vous cherchez un logiciel de gestion avec CRM, pré-comptabilité et facturation.

Le logiciel est assez proche d’Axonaut et Evoliz en terme de fonctionnalités et de vision en étant, selon nous, légèrement plus complet.

Sellsy est un acteur historique du logiciel SaaS français avec une excellente réputation (même si certaines augmentation de prix lui ont valu des critiques à certains moments).

Le logiciel Henrri est un ancien logiciel de facturation gratuit et sans publicité devenu payant au fur et à mesure ces dernières années (oui on dénonce).

Avec l’arrivée d’Indy sur le segment du gratuit, Henrri a du soucis à se faire.

Le business model du logiciel se base sur des options payantes à ajouter à l’offre gratuite et des abonnements payants. Le logiciel de devis facturation, uniquement disponible en version desktop, propose de nombreuses fonctionnalités qui conviennent particulièrement aux petites entreprises.

La version gratuite d’Henrri reste tout de même l’une des plus complète du marché, si vous arrivez à passer outre le design un peu daté, on ne peut que vous recommander Henrri sur sa version gratuite, un peu moins sur la payante, il y a mieux ailleurs.

Zervant est un outil pour éditer vos devis et factures avec une interface bien pensée, intuitive et complète. Le logiciel propose une version gratuite très intéressante ainsi qu’une version payante avec les fonctionnalités basiques et d’autres fonctionnalités différenciantes (application mobile, paiement depuis le logiciel, rappel de paiements). Le logiciel convient à de nombreux profils d’entrepreneurs.

Même si le logiciel est très complet, Zervant évolue peu ces dernières années et nous le recommandons plus sur sa version gratuite, très complète si vous ne dépasser pas 5 factures et 5 clients par mois, que sur sa version payante.

Obat est un logiciel de facturation premium pour les artisans du bâtiment et concurrent direct de Costructor et Tolteck. Avec plus de 20 000 clients, Obat est en bonne position sur le podium des logiciels pour artisans.

Le logiciel propose, en plus des fonctionnalités classiques sur la création de devis et factures, des fonctionnalités pensées pour les artisans :

• Bibliothèque d’ouvrages ;
• Accessibilité depuis mobile, tablette et ordinateur ;
• Signature électronique simple ;
• Gestion facilitée des avoirs, situations et acomptes ;
• Connexion bancaire ;
• Marketplace ;
• Rentabilité de chantier.

Seul bémol chez Obat, le prix : à partir de 39€HT/mois pour un abonnement mensuel ce qui est souvent trop élevé pour les nouveaux artisans. Obat est un logiciel « premium » qui convient soit aux néoentrepreneurs qui sont prêts à investir dans un logiciel qui leur apportera bien plus que ce qu’il ne coûte ou aux TPE/PME bien installées.

Le logiciel MaCompta.fr est un logiciel de facturation, de comptabilité et d’édition de liasse fiscale créé en 2009. Le logiciel est un des moins chers du marché et convient à un large éventail d’activités et de formes juridiques. MaCompta s’adresse aux non-spécialistes de la comptabilité avec un logiciel très simple d’utilisation.

Avec un tarif à 7€/mois, le logiciel de facturation possède un des meilleurs rapports qualité prix. Le logiciel de facturation peut-être pris sans le logiciel de comptabilité de MaCompta.fr. Nous recommandons souvent MaCompta à nos visiteurs qui nous réclame un « logiciel de facturation pas cher ».

Mais attention tout de même, le logiciel est plus limité sur l’automatisation.

Factomos est un logiciel de devis et facturation qui mise sur la rapidité de prise en main. Le logiciel est très polyvalent puisque cible de nombreux profils :

• Microentrepreneurs ;
• Agences ;
• Professionnels libéraux ;
• Artistes/auteurs ;
• Startup ;
• PME.

Factomos manque, selon nous, d’une spécialisation plus clair et d’un peu plus de facilité d’utilisation pour que nous le recommandons plus. Le logiciel reste très bien pensé mais il y a souvent mieux en face. Le prix, plutôt élevé, n’aide pas à le recommander.

Notre objectif est simple : vous aider à faire le bon choix grâce à nos conseils et une analyse détaillée et indépendante des différents logiciels de facturation.

Nous mettons tous les éléments en notre possession à votre disposition dans ce comparatif pour vous aider à faire votre choix.

Quels sont les profils de clients des logiciels de facturation ?

La plupart des logiciels ciblent un segment précis de professionnels : TPE, microentrepreneur, artisan, freelances… En fonction de votre profil, vous pourrez effectuer un premier tri parmi les nombreux logiciels de facturation qui existent sur le marché.

Il est possible, dans la plupart des cas, d’utiliser les logiciels de facturation même si vous n’êtes pas dans le cœur de cible. Nous vous conseillons tout de même d’utiliser un logiciel qui s’adresse à vous de manière explicite. En plus des fonctionnalités dédiées à votre profil de professionnel, les logiciels ont tendance à « mieux traiter » les profils surreprésentés parmi leurs clients pour devenir la référence sur leur marché.

Quels sont les prix des logiciels de facturation ?

Le nerf de la guerre pour la plupart des entrepreneurs. Chez Tool Advisor, un de nos principaux conseils est d’encourager les entrepreneurs et décideurs à aller au-delà du prix pour choisir l’outil de facturation qui leur correspond. Faites la liste de vos besoins principaux et secondaires, comparez les fonctionnalités proposées par les logiciels et arbitrez ensuite.

Les logiciels de facturation proposent différents abonnements en fonction de vos besoins. Ils proposent aussi des essais gratuits ou du freemium pour vous encourager à tester et utiliser leur logiciel.

Quelles sont les fonctionnalités des logiciels de facturation ?

Il existe autant d’usage des logiciels de facturation que d’entrepreneurs. Les logiciels proposent des fonctionnalités qui vont au-delà de la simple édition de devis et factures.

• Sécuriser l’envoi de vos factures, de vos devis, la réception de vos paiements et le stockage de vos documents ;
• Automatiser vos processus (alertes, notifications par email, facturation récurrente) ;
• Visualiser vos recettes, dépenses, chiffre d’affaires, paiements en attente, vos impayés, délai de paiement moyen, nombre de factures en attente et de vos stocks avec des tableaux de bord ;
• Gérer votre relation client ;
• Faciliter vos déclarations et votre comptabilité ;
• Respecter les obligations légales (numérotation de facture chronologique, mentions obligatoires conformes à la règlementation en vigueur, respect de la loi anti-fraude à la TVA).

C’est à vous de vous demander les fonctionnalités absolument nécessaires pour vous et celles plus optionnelles. Nous vous détaillons les fonctionnalités qui peuvent faire la différence dans votre choix.

Logiciel de facturation : nos recommandations

Selon nous, le meilleur logiciel de facturation n’existe pas. Vous devez choisir celui qui vous correspond en fonction de votre profil, votre budget, votre activité et les fonctionnalités dont vous avez besoin.

Pour vous aider, on se mouille en vous donnant quelques recommandations en fonction de votre profil.

✅ Pennylane pour les professionnels qui cherchent un logiciel de facturation et comptabilité tout en un, il s’agit du meilleur logiciel du marché ;

✅ Abby pour les microentrepreneurs ;

✅ Freebe pour les freelances qui cherchent un logiciel spécialisé ;

✅ Obat, Tolteck ou Costuctor pour les artisans du bâtiment ;

✅ Indy pour les professionnels qui cherchent un logiciel gratuit ;

✅ Evoliz et Axonaut pour les TPE qui cherchent un logiciel polyvalent.

N’hésitez pas à profiter des essais gratuits des logiciels pour être sûr que le logiciel correspond à vos besoins et vos attentes.

Comparatif logiciel de facturation 2025 : le récap’

Ce tableau obéit à certaines règles :

• Les prix annoncés correspondent aux prix affichés sur les sites des logiciels de facturation ou communiqués par les logiciels eux-mêmes ;
• Ce tableau évolue régulièrement en fonction des nouveautés, de nos analyses et des retours de nos utilisateurs.

Quelles sont les alternatives aux logiciels de facturation en ligne ?

Comment choisir le logiciel de facturation qui vous correspond ?

Si vous êtes un auto-entrepreneur ou une petite entreprise, ces logiciels peuvent vous convenir, tout dépend souvent du nombre de factures à gérer. Si vous voulez des fonctionnalités plus poussées. Il faudra opter pour un logiciel payant. La limite entre gratuit et payant se situe souvent au niveau de l’automatisation (rappel, relance, facturation automatique, facturation récurrente), de la précomptabilité et de la partie analytique (statistique, tableau de bord, données financières consolidées, prévisionnel chiffre d’affaires, recettes et dépenses).

Quelles sont les fonctionnalités indispensables pour gérer vos devis et factures ?

Comment nous l’avons vu précédemment, les logiciels de facturation gratuits répondent tout de même à beaucoup de besoins. Si vous souhaitez plus de fonctionnalités, classez-les de la plus importante à la moins importante.

Les logiciels de facturations payants vont plus loin dans les fonctionnalités complémentaires. Avez-vous besoin d’un mini-CRM/ERP pour la gestion de vos clients, d’une fonctionnalité export du fichier des écritures comptables (FEC), d’un tableau de bord avec de nombreux KPI, d’un suivi de trésorerie complet, d’un module gestion de projet et d’une application mobile ?

Nous vous conseillons de réfléchir au gain de temps que vous amènera le logiciel. Un logiciel de devis et facturation coûte rarement plus de 25€ par mois, si vous gagnez 1 ou 2h par semaine, l’outil de facturation est rapidement rentabilisé.

Avez-vous besoin d’intégrer votre outil de facturation avec d’autres logiciels ?

Les logiciels de facturation s’intègrent souvent avec d’autres logiciels de gestion d’entreprise comme :

• Les experts-comptables en ligne ;
• Les logiciels de note de frais ;
• Les logiciels de comptabilité ;
• Outils de stockage de documents ;
• Les logiciels de gestion et règlement des factures fournisseurs ;
• Les logiciels de trésorerie.

La question est simple : avez-vous besoin que votre outil de facturation soit relié à un autre logiciel ? Si oui, regardez si l’intégration est possible et facilement réalisable. Ces intégrations vous feront gagner du temps et éviteront les erreurs du à la saisie manuelle des factures.

Comment allez-vous gérer votre comptabilité ?

Si vous êtes un microentrepreneur ou un professionnel libéral, la question ne se pose pas puisque votre comptabilité est simplifiée. Si vous êtes en société, il peut être intéressant de regarder du côté des logiciels de comptabilité ou des experts comptables en ligne qui proposent des modules de facturation au sein de leur logiciel.

Une autre solution consiste à relier votre logiciel de facturation à votre logiciel de comptabilité, ce paramétrage est souvent simple à effectuer. Les logiciels de facturation proposent un « accès expert-comptable » pour faciliter la gestion de votre comptabilité.

Si vous vous demandez si un logiciel de facturation est obligatoire pour votre activité professionnelle : la réponse est non. L’obligation, issue de la Loi de finance 2018, porte uniquement sur les logiciels de caisse. Vous pouvez tout à fait réaliser vos devis et factures sur Excel, Google Sheets ou au format papier tant qu’elles respectent toutes les mentions légales obligatoires.

Choisir le bon logiciel de facturation prend du temps. C’est pour cette raison que nous avons créé Tool Advisor. En plus de ce comparatif logiciel de facturation, nous mettons à votre disposition un questionnaire rapide qui vous oriente vers le logiciel qui vous correspond en moins de 2 minutes.

Pour en savoir plus :

👉 Nos 8 conseils pour choisir le logiciel de facturation qui vous correspond

FAQ – Les questions fréquentes sur les outils de facturation

Quel est le meilleur logiciel de facturation ?

Le meilleur logiciel de facturation n’existe pas. Vous devez cherchez le logiciel de facturation en ligne qui correspond à votre profil et votre besoin. Les logiciels que nous recommandons le plus sont Pennylane, Abby, Indy et Evoliz mais nous vous conseillons de prendre le temps de bien comparer les différents logiciels.

Quel est le meilleur logiciel de facturation gratuit ?

Pour les logiciels de facturation gratuits, notre recommandations est plus simple : nous vous conseillons Indy, Abby ou Tiime. Les autres logiciels de facturation gratuits seront trop limités.

Quel est le logiciel de facturation le moins cher ?

Nous vous conseillons de regarder du côté des logiciels de facturation gratuits comme Indy, Abby ou Qonto.

Le logiciel de facturation est-il obligatoire ?

Le logiciel de facturation n’est pas obligatoire mais conseillé. Le prix d’un logiciel de facturation en ligne sera rapidement compensé par le temps gagné sur la gestion de votre facturation.

Gatien Guemas

Fondateur de Tool Advisor

Gatien est spécialiste des logiciels B2B et du SEO. Après 5 ans au marketing de logiciels B2B en salarié puis en freelance, il est passé de l’autre côté de la barrière pour lancer Tool Advisor et aider les entrepreneurs à choisir le logiciel qui leur correspond.

Ses trois logiciels préférés : Notion, Calendly pour prendre des rendez-vous et l’indispensable Suite Google.