Les 5 meilleurs logiciels de paie en ligne en 2025

Juliette Lécureuil – mis à jour le 11/02/2025

Le logiciel de paie pour TPE quand on est à la tête d’une très petite entreprise – moins de 10 salariés et un chiffre d’affaires inférieur à 10 millions d’euros annuels –, c’est un incontournable. 

D’abord, parce qu’il n’y a aucun intérêt à traiter la paie de ses collaborateurs manuellement – on risque de faire des erreurs et d’obtenir des fiches de paie non conformes à la loi. Ensuite, parce qu’il vaut mieux s’équiper d’un outil adapté à la taille de son entreprise…

Forcément, on n’a pas les mêmes besoins en matière de logiciel quand on a un petit effectif que quand on est à la tête d’une organisation de 10.000 salariés ! Dans cet article, on vous aide à choisir votre solution de paie pour TPE, en vous donnant notre sélection.

Bonne lecture !

Si vous avez la flemme de parcourir notre article, voici nos recommandations :

  • PayFit pour le logiciel de paie le plus complet du marché ;
  • Silae pour les professionnels de la paie ;
  • MaCompta pour la facilité d’utilisation.

Notre sélection de 5 logiciels de paie pour TPE

PayFit, le logiciel de paie en ligne avec SIRH

payfit logiciel de paie tpe

Premier outil de notre sélection : Payfit, la licorne française de la bande ! Un outil facile et agréable à utiliser grâce à son design pointu, doté de nombreuses fonctionnalités et qui permet d’effectuer une gestion avancée de la paie.

Bon, dit comme ça, on a un peu l’impression de vous présenter la Rolls du logiciel… Mais vu le gain de productivité qu’il offre, on n’en est pas loin. En effet, en plus de la gestion de la paie, Payfit propose aussi des fonctionnalités qui le rapprochent d’un logiciel RH ou SIRH.

Seul hic : si vous êtes à la tête d’une TPE avec un petit budget, son prix peut vous sembler un peu excessif, et l’absence d’offre d’essai peut facilement vous refroidir. Difficile de souscrire à un logiciel quand on n’est pas sûr que son ergonomie convient !

Listo Paye, la préparation de la paie en ligne

listo paye en ligne

Deuxième logiciel de paie en ligne que l’on souhaite faire figurer dans cette sélection : Listo Paye. Française mais pas licorne – n’a pas une corne au milieu du front qui veut –, cette solution de paie en ligne gagnerait à être plus connue

Ciblant les petites entreprises, elle comporte toutes les caractéristiques essentielles d’un logiciel de paie, avec par-dessus le marché des fonctionnalités RH, mais en option. Si vous cherchez un vrai outil vraiment tout-en-un, passez votre chemin… 

Mais si votre quête – oui, on dirait bel un bien une phrase tout droit sortie d’un jeu vidéo – est celle d’un logiciel de paie en ligne complet, simple à utiliser et qui vous permet de bénéficier d’un accompagnement de qualité, Listo Paye est tout trouvé !

Sage paie, la comptabilité avec paie en ligne

sage paie en ligne

Troisième logiciel de notre sélection : Sage Paie, le logiciel de gestion de la paie en ligne édité par le même éditeur que l’ERP/l’outil de comptabilité Sage, l’un des leaders mondiaux de l’édition de logiciels (rien que ça). 

Ce qui fait de ce logiciel de paie en ligne une des figures incontournables de notre top 5, c’est la qualité de son accompagnement. Certes, certains logiciels en self-service sont plus rapides à apprivoiser et faciles à utiliser… 

Mais le soin avec lequel les utilisateurs de Sage Paie sont accompagnés fait de ce logiciel de paie un meilleur logiciel que d’autres plus simples. Vous l’aurez compris : au moment de souscrire, on vous recommande chaudement d’opter pour la version “+ accompagnement”.

Fiche-paie.net, la paie en ligne pour les besoins simples

fiche paie net en ligne

Conçu tout particulièrement pour les indépendants et les TPE, le logiciel pour fiche de paie en ligne Fiche-paie.net fait lui aussi partie de nos chouchous. Très facile à utiliser, il va à l’essentiel et permet d’effectuer efficacement la gestion de la paie pour son entreprise. 

Pas de fonctionnalités SIRH, un design plutôt “brut de décoffrage”… Mais plus de 1000 conventions collectives prises en charge et des tarifs extrêmement compétitifs, la baseline de Fiche-paie.net pourrait être “sans chichis”. 

Si vous êtes à la recherche du logiciel le plus simple possible, il fera sans doute votre bonheur… En revanche, si vous cherchez un logiciel de paie avec des fonctionnalités RH ou qui s’approche du logiciel SIRH, vous pouvez continuer à chercher !

MaCompta, le logiciel de paie en ligne aux prix bas

macompta logiciel de paie en ligne

Last but not least, MaCompta est également une bonne option pour les petites structures en quête d’une solution de paie en ligne complète.

Plus connue pour ses fonctionnalités de comptabilité en ligne et de facturation – après tout, elle ne s’appelle pas MaCompta pour rien –, elle fait figure d’ERP pour les TPE, puisqu’elle offre un ensemble de modules nécessaires au pilotage d’entreprise.

Si votre entreprise compte moins de 20 salariés et que vous recherchez un logiciel de gestion de paie à la fois complet et efficace pour gérer ET la paie ET la comptabilité/facturation –, MaCompta devrait bien vous convenir… 

Le seul cas de figure où l’on vous conseille de rebrousser chemin, c’est si vous avez des stocks à gérer : l’outil n’ayant pas de fonctionnalité gestion des stocks, vous ne pourrez pas compter sur lui pour piloter votre activité !

Quelles sont les alternatives aux logiciels de paie en ligne ?

Vous n’avez pas envie de vous doter d’un logiciel de paie en ligne ? Pas de panique, il existe des solutions alternatives.

Première alternative au logiciel de gestion de la paie en ligne : votre expert-comptable, qu’il soit physique ou en ligne, ou un chargé de gestion sociale externe.

En réalité, on vous recommande même de faire appel à l’un des deux si vous avez peur de faire des erreurs, tant la gestion sociale d’une entreprise peut s’avérer compliquée. Autant confier la tâche à des experts dont c’est le métier !

Deuxième alternative (sur deux, désolés de vous décevoir) s’il s’agit d’une histoire de budget : utiliser un logiciel de préparation et de distribution de la paie pour éditer vous-même les fiches de paie et les transmettre à votre expert-comptable

Bon, on doit vous avouer qu’on est un peu circonspect sur la deuxième qui ne nous semble pas représenter un gain de temps tellement important… Mais on sait combien équilibrer ses finances peut se révéler crucial pour les entreprises qui débutent.

Quel est le prix d’un logiciel de gestion de la paie en ligne ? 

Pour 10 fiches de paie, le prix d’un logiciel de paie en ligne oscille – en tout cas, pour ce qui concerne les logiciels de notre top 5 ci-dessus – entre 80 €/mois (Listo Paye) et 164 €/mois (Payfit).

Un écart du simple au double, qui témoigne du fait qu’il y en a pour tous les besoins et pour toutes les bourses.

Néanmoins, si l’on sait que le budget est un point très important quand on pilote une entreprise, on vous conseille de vous concentrer sur les fonctionnalités, le design et l’ergonomie avant de considérer le prix. 

En faisant l’inverse, vous risquez de vous retrouver avec un logiciel certes bon marché (ou en tout cas, dans votre budget) mais qui ne remplit pas son office et ne vous permet pas d’effectuer les tâches pour lesquelles vous y avez souscrit. 

Comment choisir son logiciel de paie en ligne ?

À la question “comment bien choisir son logiciel de paie en ligne ?”, on a peur de devoir à nouveau vous répondre… En commençant par vous poser les bonnes questions !

Logiciel de paie en ligne

Oui, on sait, on radote. Mais si l’on répète inlassablement les mêmes choses, c’est parce que dans le fond, ça ne change pas : pour s’équiper d’un logiciel adapté à son usage et à son activité, il faut avant tout connaître son besoin. Pour cela :

  • Demandez-vous quelles fonctionnalités, parmi celles que vous espérez retrouver dans la solution de vos rêves, sont vraiment indispensables. En listant celles dont vous ne pouvez pas vous passer, vous verrez que d’autres sont secondaires ; 
  • Priorisez ce qui est le plus important pour vous : vous ne ferez pas le même choix selon que votre priorité soit d’avoir accès à de l’accompagnement de qualité, à un support en français ou à un ERP complet avec des fonctionnalités complémentaires ;
  • Fixez-vous un budget. Même si, comme expliqué ci-dessus, on recommande de ne pas se focaliser sur le prix et de considérer d’abord les fonctionnalités, il faut quand même poser une limite ;
  • Établissez une shortlist des logiciels qui correspondent à vos besoins en matière de fonctionnalités et rentrent dans votre budget. Un conseil : accordez-vous une petite marge pour le cas où le logiciel de vos rêves est un petit poil plus cher que prévu ;
  • Si vous n’arrivez pas à vous décider, souscrivez aux essais gratuits quand il y en a. Objectif : vous faire une idée de l’ergonomie de l’outil… Il faut que vous soyez à l’aise à l’utiliser ;
  • S’il n’y a pas d’essai gratuit – ceux qui suivent savent que c’est le cas de certains logiciels de notre liste –, regardez attentivement les vidéos démo pour pouvoir un aperçu de cette ergonomie ;
  • Enfin, comparez le design des outils de votre shortlist. Cela peut paraître futile mais au même titre que l’on se sent plus à l’aise dans certains environnements que dans d’autres, on est plus à l’aise avec certains outils qu’avec d’autres.

Normalement avec tout ça, vous devriez pouvoir faire le bon choix en matière de logiciel de paie en ligne… À vous de jouer !

auteur-juliette Juliette Lécureuil

Journaliste

Juliette est journaliste, rédactrice et community manager freelance.

Diplômée de l’École publique de journalisme de Tours et passée par Prisma Media, l’EFS et LCI, Juliette écrit sur tous les sujets liés à l’entrepreneuriat et aux logiciels B2B.

Ses trois logiciels préférés : Notion pour l’organisation, Indy pour la compta et MerciApp pour l’orthographe irréprochable.

Découvrez le logiciel de paie qui correspond à votre profil, vos besoins et vos critères en moins de 2 minutes.