Les 5 meilleurs logiciels de paie pour les TPE

Juliette Lécureuil – mis à jour le 12/02/2025

Le logiciel de paie pour TPE quand on est à la tête d’une très petite entreprise – moins de 10 salariés et un chiffre d’affaires inférieur à 10 millions d’euros annuels –, c’est un incontournable. 

D’abord, parce qu’il n’y a aucun intérêt à traiter la paie de ses collaborateurs manuellement – on risque de faire des erreurs et d’obtenir des fiches de paie non conformes à la loi. Ensuite, parce qu’il vaut mieux s’équiper d’un outil adapté à la taille de son entreprise…

Forcément, on n’a pas les mêmes besoins en matière de logiciel quand on a un petit effectif que quand on est à la tête d’une organisation de 10.000 salariés ! Dans cet article, on vous aide à choisir votre solution de paie pour TPE, en vous donnant notre sélection.

Bonne lecture !

Si vous avez la flemme de parcourir notre article, voici nos recommandations :

  • PayFit pour le logiciel de paie le plus complet du marché ;
  • Silae pour les professionnels de la paie ;
  • MaCompta pour la facilité d’utilisation.

Notre sélection de 5 logiciels de paie pour TPE

PayFit

payfit logiciel de paie tpe

On commence par le logiciel de paie pour TPE français Payfit, licorne française que l’on apprécie autant pour sa facilité d’utilisation et son design, que parce qu’il permet une automatisation avancée de la paie. 

Une qualité très importante pour les dirigeants d’entreprise de petite taille, dont on sait qu’ils cherchent à s’équiper d’outils leur permettant avant tout de gagner du temps. C’est le cas de Payfit, dont les fonctionnalités offrent d’importants gains de productivité.

Malheureusement pour les entrepreneurs qui disposent d’un mini budget, ce logiciel de gestion de la paie pour TPE reste cher, et l’absence d’offre d’essai ne permet pas de se faire une idée de son fonctionnement avant de souscrire… Personne n’est parfait !

Listo Paye, le logiciel polyvalent

listo paie tpe

Listo Paye n’est pas le logiciel de paie le plus connu… Et pourtant, il gagne à l’être. Ciblant les petites entreprises, l’outil s’adresse avant tout à celles en quête d’un logiciel de paie pour TPE avec des fonctionnalités RH en option. 

C’est le reproche que l’on peut adresser à l’outil : les fonctionnalités RH étant complémentaires, il conviendra à l’entrepreneur pour qui elles apparaissent comme superflues… Mais beaucoup moins à celui en quête d’un outil tout-en-un. 

Au-delà de cet inconvénient, il faut souligner la grande simplicité d’utilisation et la qualité de l’accompagnement – par des spécialistes de la paie – proposé, de même que les prix, accessibles même pour les TPE qui ne disposent que d’un petit budget pour s’équiper.

Sage Paie, le logiciel de paie pour TPE du logiciel de comptabilité Sage

sage paie tpe

Un autre bon logiciel de gestion de la paie pour TPE est le britannique Sage Paie, édité par Sage qui propose également un logiciel de comptabilité et un ERP. S’adressant aux entreprises jusqu’à 100 salariés, il convient bien aux petites structures. 

Bien qu’il soit possible de l’utiliser avec ou sans accompagnement, on recommande vivement la formule “avec” : selon nous, d’autres logiciels en self service sont plus accessibles… Mais la formation et le support propulsent Sage Paie dans notre top outils. 

Côté ergonomie, le design simple de cette solution de paie pour TPE la rend plutôt agréable à utiliser. On peut notamment saluer le fait qu’elle soit un peu moins austère que ses concurrents.

Fiche-paie.net, le logiciel de paie basique

fiche paie net

Les amateurs de logiciels avec un design pointu ne seront sans doute pas séduits par Fiche-paie.net… Pourtant, cette solution de paie pour TPE présente quelques avantages non négligeables comme sa prise en main facile ou ses tarifs, vraiment très compétitifs. 

Le logiciel va à l’essentiel, et prend en charge plus de 1000 conventions collectives. Un atout pour les très petites entreprises qui n’ont pas de temps à perdre avec les sujets liés à la paie, et cherchent par conséquent un outil plutôt “less is more”. 

En laissant de côté les fonctionnalités RH, Fiche-paie.net se coupe cependant de tous les entrepreneurs en quête d’un logiciel pour fiche de paie faisant double emploi… La preuve qu’en matière d’outils, il y en a pour tous les besoins.

MaCompta, le logiciel de paie le moins cher pour les TPE

macompta paie tpe

Davantage connu comme logiciel de comptabilité en ligne que comme solution de paie en ligne pour TPE, MaCompta a pourtant de nombreux avantages en la matière. Sorte d’ERP pensé pour les TPE, l’outil propose différents modules parmi lesquels un est dédié à la paie. 

Quand on est patron d’une petite structure et en quête d’un outil complet, c’est à cette porte qu’il faut frapper : nombreuses, ses fonctionnalités répondent à tous les besoins que l’on peut avoir en tant que dirigeant d’une TPE de moins de 20 salariés. Nous le recommandons également pour les « petites PME » qui cherchent un logiciel de paie à un prix compétitifs.

Un fit à nuancer quand l’activité nécessite de suivre les stocks : MaCompta est facile à utiliser, doté d’un très bon service client en cas de problème, mais son prix doux n’inclut malheureusement pas de module de gestion des stocks… On ne peut pas tout avoir !

Dougs, l’expert-comptable en ligne avec un service paie

dougs social paie tpe

Dernier de notre liste, l’expert-comptable en ligne Dougs permet également de gérer la paie. Attention néanmoins : la gestion de la partie sociale fait partie des prestations complémentaires, au tarif de 30 €/mois par bulletin de salaire. 

Certes, l’outil n’est pas un logiciel de paie pour TPE à proprement parler. Mais c’est une option à envisager pour les dirigeants qui souhaitent à la fois faire appel aux services d’un expert-comptable en ligne et s’équiper pour gérer la paie de leurs salariés. 

Parmi les logiciels d’expertise-comptable en ligne, Dougs fait partie de ceux que nous conseillons le plus souvent car il est complet, aisé à prendre en main et qu’il permet d’être accompagné de manière illimitée par un comptable dédié.

En revanche, toutes les activités ne sont pas prises en charge et la startup lyonnaise fixe un seuil de chiffre d’affaires à ne pas dépasser pour pouvoir continuer à bénéficier de ses services… Reste à voir si vous rentrez dans les clous ! 

Quelles sont les fonctionnalités d’un logiciel de paie pour TPE ?

La bonne nouvelle, c’est qu’il est – pour une fois – assez simple d’apporter une réponse à cette question, puisque les fonctionnalités listées ci-dessous sont toutes indispensables au bon fonctionnement d’un logiciel pour fiche de paie. On pense :

  • À la génération des fiches de paie des collaborateurs ;
  • À leur dématérialisation – aujourd’hui, rares sont les salariés à se plaindre de ne plus recevoir de bulletin de salaire au format papier ;
  • À la prise en compte de tous les éléments variables de la paie (primes, absences, heures supplémentaires, etc.) ;
  • À la création de l’ensemble des documents concernant le volet social de l’entreprise ;
  • À l’intégration des écritures de paie avec le logiciel de comptabilité ;
  • À la tenue du registre du personnel, très importante puisqu’il peut faire l’objet d’un contrôle ;
  • À la télédéclaration, chaque mois, des déclarations sociales nominatives (DSN) ;
  • Et à l’acquittement des différentes cotisations.

Quels sont les prix d’un logiciel de comptabilité pour TPE ?

On le sait : pour beaucoup de très petites entreprises, allouer un budget à un outil dont la fonction n’a rien à voir avec leur cœur d’activité est difficile. On comprend, dans ce cas, pourquoi l’aspect financier est primordial. 

Mais le meilleur conseil que l’on puisse vous donner si c’est votre cas, c’est de ne pas fonder votre choix sur le seul critère du prix, et de considérer avant tout l’adéquation entre votre besoin et le logiciel auquel vous envisagez de souscrire.

Logiciel de paie tpe

En ne portant attention qu’au prix, vous risquez de vous équiper d’un logiciel de paie pour TPE qui ne vous correspond pas, et de faire un mauvais investissement… Ce qui serait contre-productif

Comment choisir le logiciel de paie qui vous correspond ?

Étant donné qu’elles sont toutes obligatoires au bon fonctionnement d’un logiciel pour fiche de paie, difficile d’effectuer une bonne comparaison des logiciels listés ci-dessus en se fondant uniquement sur leurs fonctionnalités

Les outils de notre sélection offrant tous les fonctionnalités de base, il faut s’intéresser aux fonctionnalités complémentaires, comme le volet RH pour Listo Paye, les autres modules de l’ERP pour MaCompta ou l’expertise-comptable pour Dougs, pour les départager.

Pour choisir son logiciel de paie, on conseille avant tout de cartographier les différentes fonctions pour lesquelles l’entreprise a besoin d’être outillée. Comptabilité, facturation, déclarations sociales, gestion de la paie…  

Il existe peut-être un outil qui réunit toutes ces fonctions, et la souscription reviendra peut-être moins cher que de payer une multitude de logiciels différents. Mieux encore, elle permettra d’effectuer un ensemble de tâches au sein d’un même environnement. 

Une fois que vous aurez bien défini le périmètre de vos besoins, vous aurez déjà exclu les logiciels de notre sélection qui ne sont pas faits pour vous. Pour trouver le logiciel de paie pour TPE idéal, il ne vous restera plus qu’à faire votre choix parmi la shortlist.

Si malgré tout le choix reste difficile, on vous conseille de faire un petit tour sur les sites des logiciels, de souscrire aux essais gratuits quand il y en a ou de regarder un maximum de vidéos démo. 

Vous verrez que le design et l’ergonomie ont leur importance, et vous saurez assez vite quel logiciel de paie pour TPE est fait (ou non) pour vous !

Articles associés :

auteur-juliette Juliette Lécureuil

Journaliste

Juliette est journaliste, rédactrice et community manager freelance.

Diplômée de l’École publique de journalisme de Tours et passée par Prisma Media, l’EFS et LCI, Juliette écrit sur tous les sujets liés à l’entrepreneuriat et aux logiciels B2B.

Ses trois logiciels préférés : Notion pour l’organisation, Indy pour la compta et MerciApp pour l’orthographe irréprochable.

Découvrez le logiciel de paie qui correspond à votre profil, vos besoins et vos critères en moins de 2 minutes.