Quel est le meilleur logiciel de facturation pour autoentrepreneur en 2025 ?

auteur-tool-advisor Par Gatien Guemas | Le 26/06/2025

Vous êtes autoentrepreneur et vous recherchez le logiciel de facturation idéal pour votre activité ? Vous êtes au bon endroit.

En complément, de notre comparatif des meilleurs logiciels de facturation, nous nous concentrons aujourd’hui uniquement sur les logiciels de facturation à destination des autoentrepreneurs.

Tool Advisor c’est quoi ? C’est un comparateur qui compare vraiment. Nous testons, analysons et décryptons chaque logiciel présent sur Tool Advisor pour vous donner nos conseils en gardant notre indépendance.

Pour vous proposer le comparatif des logiciels de facturation pour autoentrepreneur ou microentrepreneur le plus complet et transparent, nous avons analysé les logiciels de facturation selon le même processus :

  • Analyse des fonctionnalitĂ©s et du site internet ;
  • Test du logiciel ;
  • Échanges avec des utilisateurs satisfaits et insatisfaits ;
  • Étude de l’e-rĂ©putation ;
  • Analyse des tarifs ;
  • Étude des points forts et des points faibles ;
  • DĂ©finition du profil de client idĂ©al pour chaque logiciel de facturation.

Pour vous faire gagner du temps, nous avons aussi développé un outil gratuit (qui s’adresse à tous les profils de professionnels) qui vous donne une recommandation personnalisée et détaillée en fonction de votre profil et de votre besoin.

Notre sélection de 8 logiciels de devis facture pour autoentrepreneur

Deux types de logiciels seront présentés dans cet article : les logiciels spécialisés sur la facturation et les logiciels spécialisés sur la comptabilité. Le but est de couvrir l’ensemble des besoins des autoentrepreneurs, des plus simples au plus poussés.

logiciel de facturation autoentrepreneur

Les 8 logiciels de devis-facture que nous recommandons le plus aux autoentrepreneurs sont :

  • Abby ;
  • Indy ;
  • Freebe ;
  • Pennylane ;
  • Evoliz ;
  • Tiime ;
  • Sage ;
  • Macompta.

Auparavant parmi les logiciels les plus recommandés, nous ne conseillons plus Quickbooks car la version française du logiciel a fermé fin 2023.

Les logiciels sélectionnés dans cet article obtiennent les meilleures notes sur Tool Advisor grâce à un bon équilibre entre excellent niveau de satisfaction client, facilité d’utilisation et nombreuses fonctionnalités dédiées aux autoentrepreneurs.

Nous avons sélectionné des logiciels de facturation qui répondent à différents besoins : des logiciels simples d’utilisation rapides à prendre en main, des logiciels qui s’intègrent avec d’autres outils complémentaires, des logiciels pour différents budgets et surtout des logiciels de devis facture avec des fonctionnalités dédiées aux autoentrepreneurs.

En deux mots : il y en a pour tous les budgets et tous les besoins (OK ça fait plus que 2 mots).

Abby, le leader de la facturation pour les autoentrepreneurs

Abby autoentrepreneur

Abby est un logiciel de facturation complet pour les autoentrepreneurs. Déjà utilisé par plus de 100 000 entrepreneurs, le logiciel s’est rapidement imposé comme un des plus utilisés par les autoentrepreneurs qui composent son cœur de cible.

Le logiciel est plus qu’un logiciel de facturation puisqu’il couvre l’ensemble de la gestion d’une microentreprise :

  • Édition de devis et facture ;
  • DĂ©claration ;
  • ComptabilitĂ© ;
  • Pilotage.

Le logiciel est simple à utiliser et très complet avec une note de satisfaction client très élevé sur Tool Advisor.

Seul bémol : il ne convient pas aux sociétés. Si votre microentreprise évolue, il faudra donc trouver un autre logiciel de facturation.

Abby est un des logiciels que nous recommandons le plus aux autoentrepreneurs aussi bien sur sa version gratuite que sur sa version payante.

Le logiciel est sans engagement et propose une version d’essai de 7 jours, idéale pour se familiariser avec le logiciel.

Prix (Ă  partir de) Lien vers le site
Abby Ă€ partir de 0€HT/mois Voir l’offre pour les autoentrepreneurs

Indy, le robot-comptable avec une offre très compétitives pour les autoentrepreneurs

indy autoentrepreneur

Indy est un logiciel de comptabilité qui propose également un logiciel de facturation gratuit. Historiquement, le logiciel automatise la comptabilité des indépendants et des sociétés. Indy a récemment sorti un logiciel de facturation qui intéressera les autoentrepreneurs.

Le logiciel est utilisé par plus de 100 000 entrepreneurs.

Moins complet sur la partie facturation que d’autres logiciels, le logiciel est très complet sur la partie comptabilité :

  • Édition de devis et facture ;
  • Automatisation de la comptabilitĂ© (Synchronisation bancaire, catĂ©gorisation intelligente)  ;
  • Pilotage.

Le logiciel est sans engagement et propose une version d’essai de 15 jours, idéale pour se familiariser avec le logiciel. Le logiciel propose également une version gratuite de son logiciel de comptabilité. Vous avez aussi un mois offert en passant par Tool Advisor.

Prix (Ă  partir de) Lien vers le site
Indy Ă€ partir de 0€HT/mois Voir l’offre pour les autoentrepreneurs

Freebe, le spécialiste des freelances en microentreprises

Freebe autoentrepreneur

Si vous cherchez un logiciel pour autoentrepreneur spécialisé uniquement sur les freelances, difficile de faire mieux que Freebe qui a développé tout son logiciel en fonction des problématiques des freelances. Un logiciel pour les freelances par des freelances (comme ils disent).

Le logiciel couvre l’ensemble des besoins des autoentrepreneurs :

  • Édition de devis et facture ;
  • Gestion client ;
  • Suivi des temps ;
  • Synchronisation bancaire ;
  • Recettes / Achats ;
  • DĂ©claration de CA ;
  • Paiements ;
  • App mobile ;
  • Dashboard.

Freebe fait partie des 3 logiciels que nous recommandons le plus aux autoentrepreneurs.

Le logiciel est sans engagement et propose une version d’essai de 30 jours. Vous avez aussi deux mois offert avec le code TOOLADVISOR.

 

Prix (Ă  partir de) Lien vers le site
Freebe Ă€ partir de 15€HT/mois Voir l’offre pour les autoentrepreneurs

Pennylane, le leader de la comptabilité

Pennylane autoentrepreneur

Pennylane est le logiciel de comptabilité que nous recommandons le plus sur Tool Advisor. Si la version complète sera peut-être trop « complète » pour les autoentrepreneurs (Pennylane s’adresse plus aux sociétés), le logiciel reste intéressant pour les autoentrepreneurs qui ont des besoins poussés.

Au niveau des fonctionnalités Pennylane c’est :

  • L’édition de devis et facture ;
  • La centralisation des flux financiers (rĂ©cupĂ©ration de factures fournisseurs et carte de paiement Pennylane) ;
  • Le paiement en 1 clic ;
  • Le pilotage poussĂ© de votre activitĂ©.

L’intérêt de Pennylane, c’est que vous n’aurez pas besoin de changer de logiciel si vous passez en société.

Le logiciel est sans engagement et propose 15 jours offerts. Ne cherchez pas, même si on les recommande beaucoup, on n’a pas réussi à négocier une réduc’.

Prix (Ă  partir de) Lien vers le site
Pennylane Ă€ partir de 14€HT/mois Voir l’offre pour les autoentrepreneurs

Evoliz, le logiciel de pré-comptabilité qui s’adresse (aussi) aux autoentrepreneurs

Evoliz autoentrepreneur

Evoliz est un logiciel de pré-comptabilité (il ne va pas jusqu’au bilan mais prépare tous les éléments comptables et se connecte au logiciel de votre expert-comptable). Il s’adresse donc aussi bien aux autoentrepreneurs qu’aux sociétés.

Le logiciel est très complet :

  • Édition de devis et factures ;
  • Collecte des factures fournisseurs ;
  • Notes de frais ;
  • Bons de commande et livraison ;
  • Gestion des impayĂ©s ;
  • Synchronisation bancaire ;
  • PrĂ©-comptabilitĂ© ;
  • Tableaux de bord.

Le logiciel s’adresse donc aux autoentrepreneurs qui ont besoin d’un logiciel complet même si l’abonnement le moins cher reste très compétitif.

Evoliz est sans engagement et propose 30 jours d’essai.

 

Prix (Ă  partir de) Lien vers le site
Evoliz Ă€ partir de 20€HT/mois Voir l’offre pour les autoentrepreneurs

Tiime, le logiciel de facturation gratuit

tiime autoentrepreneur

Tiime est un logiciel de facturation et comptabilité complet mais nous le conseillons plus sur la partie facturation grâce à sa version gratuite très complète. C’est simple, si on compare les versions gratuites des logiciels, Tiime propose la version avec le plus de fonctionnalités :

  • Édition de devis et factures ;
  • Remises et acomptes ;
  • Relances client ;
  • Facture rĂ©currente ;
  • Application mobile

On ne parle que de la partie facturation du logiciel. Tiime, c’est aussi la gestion des achats, des notes de frais, le compte pro, les indemnités kilométriques et des tableaux de bord.

Prix (Ă  partir de) Lien vers le site
Tiime Ă€ partir de 0€HT/mois Voir l’offre pour les autoentrepreneurs

Sage, pour un outil complet de facturation

Sage autoentrepreneur

Sage est un logiciel de comptabilité au positionnement similaire à Pennylane. C’est un logiciel de comptabilité qui propose une offre intéressante pour les autoentrepreneurs avec son abonnement Sage 50 qui vous permet de gérer la gestion commerciale et la comptabilité.

Les prix sont plus élevés que les autres logiciels (à partir de 19€) mais Sage est beaucoup plus complet. On trouve que le logiciel souffre de la comparaison avec Pennylane mais c’est incontournable du marché, d’où sa présence ici.

Vous pouvez tester le logiciel gratuitement pendant 30 jours.

 

Prix (Ă  partir de) Lien vers le site
Sage Ă€ partir de 18€HT/mois Voir l’offre pour les autoentrepreneurs

Macompta.fr, l’outil de facturation le moins cher

MaCompta autoentrepreneur

Macompta.fr est un outil de gestion complet : facturation, comptabilité, paie, note de frais et immobilisations. L’objectif du logiciel est de rendre accessible la comptabilité à des débutants. Sur la partie facturation, Macompta.fr propose un des meilleurs rapports qualité/prix avec un logiciel de facturation à 8€/mois.

Malheureusement, nous le recommandons moins que les autres logiciels pour deux raisons :

  • Le manque d’automatisation ;
  • Le design et la facilitĂ© d’utilisation en retrait par rapport aux autres logiciels.

Le logiciel conviendra donc plus aux autoentrepreneurs qui ont besoin d’un logiciel simple.

 

Prix (Ă  partir de) Lien vers le site
Macompta.fr Ă€ partir de 8€HT/mois Voir l’offre pour les autoentrepreneurs

Quelles sont les fonctionnalités d’un logiciel de facturation pour autoentrepreneur ?

Il faut différencier les fonctionnalités classiques des logiciels de facturation des fonctionnalités dédiées aux autoentrepreneurs.

Les fonctionnalités des logiciels de facturation généralistes

  • Édition de devis et facture ;
  • Bons de commande et livraison ;
  • Facturation rĂ©currente ;
  • Suivi et relances des impayĂ©s ;
  • Personnalisation des devis et factures ;
  • Suivi des clients ;
  • Automatisation (rappel et alertes) ;
  • Synchronisation bancaire ;
  • Module tableau de bord.

La majorité des logiciels présentés dans cet article propose l’ensemble de ces fonctionnalités même si la qualité est inégale d’un logiciel à l’autre. L’intérêt de cet article est de se plonger dans les fonctionnalités qui vous intéressent : celles dédiées aux autoentrepreneurs.

Les fonctionnalités des logiciels de facturation pour autoentrepreneurs

La comptabilité des autoentrepreneurs est plus simple que la comptabilité des sociétés. Les fonctionnalités dédiées aux autoentrepreneurs consistent surtout à l’automatisation des déclarations de CA et aux alertes de dépassement des seuils mais ce n’est pas tout.

De nombreux logiciels se sont spécialisés sur les autoentrepreneurs du digital avec les fonctionnalités suivantes :

  • Le suivi des temps ;
  • To-do list ;
  • Personnalisation ;
  • La gestion commerciale ;
  • L’automatisation ou l’aide aux dĂ©clarations ;
  • Les intĂ©grations avec d’autres logiciels.

Certains logiciels proposent également avec la signature électronique et un mini-CRM.

Les logiciels de facturation pour autoentrepreneurs sont pour la plupart accessibles sur smartphone, tablette et ordinateur.

Quels sont les prix des logiciels de facturation pour autoentrepreneur ?

Il existe des logiciels pour tous les budgets mais une tendance se dégage : les logiciels de comptabilité avec une partie facturation sont plus chers que les logiciels de facturation spécialisés.

Chez Tool Advisor, un de nos principaux conseils est d’encourager les autoentrepreneurs à aller au-delà du prix pour choisir l’outil de facturation qui leur correspond.

Les logiciels de facturation proposent différents abonnements en fonction de vos besoins. Ils proposent aussi :

  • Des versions gratuites ;
  • Des essais gratuits de 15 ou 30 jours ;
  • Des rĂ©ductions (mois offerts ou un pourcentage de rĂ©duction pour une souscription annuelle).

On vous le répète : le prix doit être la variable d’ajustement en cas d’égalité entre 2 logiciels de devis facture.

Les prix indiqués dans la présentation de chaque logiciel de facturation pour autoentrepreneur correspondent au prix mensuel sans réduction.

Notre conseil : profitez des offres d’essai pour tester les logiciels et voir s’ils correspondent à vos besoins.

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Comment faire le bon choix de logiciel de facturation quand on autoentrepreneur ?

Le meilleur logiciel de devis et facture n’existe pas, vous devez choisir le logiciel qui correspond à vos besoins, votre profil et votre budget.

Pour vous aider, nous vous conseillons de vous poser ces 3 questions :

Avez-vous besoin d’un logiciel de facturation gratuit ou payant ?

Il existe de nombreux logiciels de facturation gratuits disponible dans notre comparatif. Ils possèdent moins de fonctionnalités que les logiciels payants et sont souvent limités mais ils permettent de gérer une facturation simple.

Ces logiciels peuvent vous convenir, tout dépend souvent du nombre de factures à gérer.

Si vous voulez des fonctionnalités plus poussées. Il faudra opter pour un logiciel payant.

La limite entre gratuit et payant se situe souvent au niveau de l’automatisation (rappel, relance, facturation automatique, facturation récurrente), de la précomptabilité et de la partie analytique (statistique, tableau de bord, données financières consolidées, prévisionnel chiffre d’affaires, recettes et dépenses).

Quelles fonctionnalités sont indispensables pour votre activité ?

Comment nous l’avons vu précédemment, les logiciels de facturation gratuits répondent tout de même à beaucoup de besoins. Si vous souhaitez plus de fonctionnalités, classez-les de la plus importante à la moins importante.

Les logiciels de facturations payants vont plus loin dans les fonctionnalités complémentaires :

  • CRM/Gestion commerciale ;
  • Export du fichier des Ă©critures comptables (FEC) ;
  • Tableau de bord ;
  • Suivi de trĂ©sorerie ;
  • Gestion de projet/chantier.

Nous vous conseillons de réfléchir au gain de temps que vous amènera le logiciel. Un logiciel de facturation coûte rarement plus de 25€ par mois, si vous gagnez 1 ou 2h par semaine, l’outil de facturation est rapidement rentabilisé.

Avez-vous besoin d’intégrer votre outil de devis facture avec d’autres logiciels ?

Les logiciels de facturation s’intègrent souvent avec d’autres logiciels utilisés par les autoentrepreneurs comme :

La question est simple : avez-vous besoin que votre outil de facturation soit relié à un autre logiciel ? Si oui, regardez si l’intégration est possible et facilement réalisable.

Choisir le bon logiciel de facturation quand on est autoentrepreneur prend du temps. C’est pour cette raison que nous avons créé Tool Advisor. En plus de cet article dédié aux logiciels de devis et facture pour microentrepreneur, nous mettons à votre disposition un questionnaire rapide qui vous oriente vers le logiciel qui vous correspond en moins de 2 minutes.

auteur-tool-advisor Gatien Guemas

Fondateur de Tool Advisor

Ses trois logiciels préférés : Notion, Calendly pour prendre des rendez-vous et l’indispensable Suite Google.

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