Les 11 meilleurs logiciels (certifiés PA) pour la facturation électronique

Par Amandine Dujardin | Le 19/06/2026

“Nul n’est censé ignorer la loi”, n’est-ce pas ? Si vous êtes ici, c’est que vous connaissez ce dicton et que vous comptez bien lui faire honneur. 

Pour rappel, les entreprises françaises devront obligatoirement émettre des factures électroniques à compter du 1er septembre 2026 pour les grandes entreprises et ETI et du 1er septembre 2027 pour les PME et micro-entreprises. 

Aussi pratique soit-il, vous devrez donc troquer votre outil de facturation non conforme par une plateforme agréée (PA) ou une solution compatible (SC) reconnue par l’État. 

Après un bref rappel des règles à respecter, nous vous présenterons 11 logiciels 100 % conformes à la facturation électronique.

Vous manquez de temps ? Voici nos solutions favorites : 

• Pennylane si vous cherchez un logiciel de comptabilité : à partir de 14€/mois ;
• Dougs si vous cherchez un expert-comptable en ligne : à partir de 79€/mois ;
• Indy si vous cherchez un logiciel de facturation ou/et de comptabilité pour les TPE : à partir de 0€/mois ;
• Abby si vous cherchez un logiciel de facturation et que vous êtes un micro-entrepreneur : à partir de 0€/mois ;
• Un logiciel spécialisé si vous êtes une PME ou si un de ces logiciels ne vous convient pas.

👉 Notre meilleur conseil : regardez du côté des logiciels que vous utilisez déjà.

Facturation électronique obligatoire : quelques piqûres de rappel

La facturation électronique obligatoire des entreprises françaises représente un changement majeur pour les sociétés. C’est pourquoi elle aura lieu progressivement à partir du 1er septembre 2026.

Voici le calendrier détaillé des prochaines mesures : 

• Toutes les entreprises auront l’obligation de recevoir des factures électroniques à partir du 1er septembre 2026 ; 
• Les grandes entreprises et les entreprises de taille intermédiaire (ETI) devront pouvoir émettre des factures électroniques à partir du 1er septembre 2026 ; 
• Les petites et moyennes entreprises (PME) et les micro-entreprises auront l’obligation d’émettre des factures électroniques à partir du 1er septembre 2027.

Que vous soyez concerné en 2026 ou 2027, la marche à suivre reste la même. Il faut vérifier que votre logiciel soit compatible avec la facturation électronique. Et si ce n’est pas le cas : en changer. 

Si votre logiciel de facturation n’est pas à la page, pas de panique ! Il suffit de parcourir notre sélection de logiciels pour la facturation électronique obligatoire pour trouver son remplaçant. 

🔎 C’est quoi une plateforme agréée (PA) ? C’est un prestataire certifié par l’administration fiscale, chargé d’émettre, recevoir et transmettre des factures électroniques conformes.

À ne pas confondre avec une solution compatible (SC) qui n’est pas une PA mais qui est un intermédiaire qui doit passer par une PA pour être conforme avec la facturation électronique.

👉 Pour tout comprendre de la réforme de la facturation électronique en 10 minutes, n’hésitez pas à consulter notre guide détaillé :

Les logiciels de facturation électronique à connaître (et à adopter dès aujourd’hui)

1) Indy : le logiciel de facturation et comptabilité pour les indépendants et les TPE

Indy est un logiciel de facturation et comptabilité à destination des les professions libérales (réglementées ou non), des sociétés à l’IS, des microentrepreneurs, des LMNP, des SCM et des SCI (sans TVA).

Indy est PA (plateforme agréée) aussi bien sur sa version gratuite que sur sa version payante.

Indy c’est tout d’abord :

• La création d’entreprise offerte
• Un logiciel de facturation gratuit

Mais c’est aussi, et surtout, un logiciel qui automatise votre comptabilité jusqu’à la production de votre bilan.

Indy en chiffres c’est :

• 200 000 utilisateurs ;
• 4,8/5 sur 13000 avis sur Trustpilot ;
• La meilleure note sur le design et la facilité d’utilisation pour les logiciels de compta sur Tool Advisor.

Bref : une valeur sûre qu’on recommande depuis des années pour les TPE et les indépendants.

💵 Prix d’Indy : une version gratuite et un abonnement payant à partir de 12€HT/mois (engagement mensuel) pour les micro-entrepreneurs et 59€HT/mois (engagement mensuel) pour les sociétés.

Indy propose désormais une offre expert-comptable pour profiter du logiciel et de l’accompagnement par un comptable.

2) Abby : le logiciel pour les micro-entrepreneurs

Abby est un logiciel de gestion pour les micro-entrepreneurs et TPE même si nous le recommandons plus pour les micro-entrepreneurs.Le logiciel fait partie des plateformes agréées françaises validées par la DGFIP.

Abby propose une version gratuite et une version payante (toutes les 2 PA).

Le logiciel proposent de nombreuses fonctionnalités :

• Édition de devis et facture ;
• Déclaration URSSAF et TVA ;
• Gestion de projet ;
• Mini-CRM ;
• Comptabilité ;
• Pilotage ;
• Compatible API tiers de prestation.

Cerise sur le gâteau : une satisfaction client largement au-dessus de la moyenne (4,9/5 sur Google Business). Abby, c’est également plus de 100 000 indépendants clients.

💵 Prix d’Abby : une version gratuite et un abonnement payant à partir de 11€HT/mois (engagement mensuel) pour les micro-entrepreneurs.

3) Tiime : un logiciel de facturation électronique 100 % gratuit

Tiime est une fintech française fondée en 2015. Depuis 10 ans, les créateurs de cet outil aident les entrepreneurs à surmonter leurs défis administratifs. 

Immatriculé PDP sous le numéro 0037, Tiime, comme les autres logiciels de facturation électronique de ce guide, vous permet d’anticiper la réforme. 

Mais pourquoi le choisir plutôt qu’un autre ? Pour ses nombreux atouts : 

• Sécurité : archivage de vos documents commerciaux pendant 10 ans ; 
• Gratuité : création illimitée de factures/devis gratuite sur Tiime ; 
• Simplicité : vos factures se trouvent à un seul endroit pour vous et vos clients ; 
• Rapidité : réception et émission des factures depuis toutes les plateformes de dématérialisation aux formats recommandés par l’État ; 
• Responsabilité : la facturation électronique réduit l’empreinte carbone de votre entreprise. 

💸 Prix de Tiime : pour la facturation, une offre gratuite à vie est disponible. Pour plus de fonctionnalités, vous devrez choisir entre le forfait Smart à 14,99 € HT/mois et le forfait Premium à 29,99 € HT/mois. 

4) Pennylane : le meilleur logiciel de comptabilité pour les TPE et PME

5) Esker : un logiciel de facturation immatriculé PDP qui assure vos arrières

Esker est une solution créée à Lyon en 1985 par son président actuel Jean-Michel Bérard. Déjà 40 ans que cette entreprise française facilite la vie des équipes Finance, Achat et Service client. 

Mais ce qui nous intéresse aujourd’hui, c’est sa compatibilité avec la facturation électronique obligatoire. Comme vous pouvez le voir sur son site, Esker fait de la facturation électronique l’une de ses priorités. 

En collaboration avec les autorités compétentes, cette solution immatriculée PDP s’assure de rester à jour des dernières réglementations. Elle vous laisse le choix sur le format des factures éditées : UBL, UN/CEFACT CII ou Factur-X. 

Enfin, Esker s’adapte aux réglementations de plus de 60 pays de façon à ce que vos clients et fournisseurs internationaux ne grimacent jamais devant vos factures. 

💵 Prix d’Esker : le tarif de cet outil pour la facturation électronique est disponible sur demande. 

6) Flowie : pour des factures électroniques conformes dans +60 pays

Flowie centralise la gestion du P2P (peer-to-peer), de l’O2C (Order to Cash) et les flux de trésorerie sur une plateforme unique. Début 2024, la start-up française a annoncé son immatriculation officielle en tant que Plateforme de Dématérialisation Partenaire (PDP) par la Direction Générale des Finances Publiques (DGFiP).

Nous vous confirmons donc que vous pouvez passer par Flowie pour vous mettre en conformité avec les exigences réglementaires françaises et étrangères. 

Ce logiciel de facturation électronique est apprécié pour son intégration native à un écosystème d’outils, son interface super moderne et son offre gratuite. 

💵 Prix : Flowie est gratuit à vie pour les TPE (moins de 100 factures par mois) et son tarif est disponible sur demande pour les entreprises émettant plus de 100 factures par mois.

7) Odoo : l’ERP open source conforme pour la facturation électronique

Nos amis belges ont, selon nous, produite ce qu’il se fait de mieux sur le marché de l’ERP avec Odoo.

Odoo cumule plein d’avantages : les prix compétitifs, la facilité d’utilisation, son agilité, ses nombreuses fonctionnalités, sa satisfaction client, son écosystème d’intégrateurs et de partenaires… et l’aspect open-source (qui n’est pas un critère d’analyse mais un vrai plus).

Honnêtement, on a longtemps était critique envers Odoo, on trouvait que le logiciel s’éparpillait et faisait tout moyennement sans rien faire parfaitement.

Nous avons changé d’avis.

Depuis quelques années, Odoo s’impose comme une référence du marché grâce à ses nombreux modules :

• Odoo CRM
• Odoo Vente
• Odoo Comptabilité
• Odoo Inventaire
• Odoo Projet
• Odoo RH
• Odoo Marketing
• Odoo e-commerce

Si le logiciel est très polyvalent, nous le recommandons plus pour les :

• TPE/PME qui ont besoin d’un logiciel de gestion complet ;
• Entreprises qui veulent un ERP modulaire et personnalisable ;
• Entreprises en croissance qui souhaitent structurer leurs processus.

C’est une des valeurs sûres du marché avec une communauté de plus de 15 millions d’utilisateurs et 190 000 clients. Le logiciel est également une plateforme agréée compatible avec la facturation électronique.

💸 Prix d’Odoo: à partir de 24,90€/mois avec une version gratuite pour la facturation. 

8) Cegid : l’outil qui vous accompagne vers la réforme de la facture électronique (e-invoicing) 

Cegid dit oui à la facture électronique ! 

Cette solution basée à Lyon a obtenu son immatriculation provisoire de Plateforme de Dématérialisation Partenaire (PDP) de la part de la DGFiP en août 2024. Il est donc sûr, en tant qu’entreprise, de passer par ce logiciel pour éditer, centraliser et gérer vos factures. De plus, cet outil fait aussi logiciel de comptabilité. 

Et bonne nouvelle pour les experts-comptables : Cegid vous aide aussi à généraliser la facture électronique de la façon la plus simple et pratique possible. 

💸 Prix de Cegid : cet outil de facturation électronique est proposé à partir de 16,95 € HT (sans engagement, 7 jours d’essai offerts). 

9) Quadient : le logiciel qui répond présent à l’obligation de facturation électronique

Quadient est un autre candidat de taille. Accrédité par l’administration fiscale, cet outil est conforme aux normes SOC II, RGPD et ISO 27001. Que vous souhaitiez passer facilement à facturation électronique ou simplifier votre gestion financière, Quadient s’avère un excellent choix. 

Ce logiciel de facturation électronique à la pointe de la technologie intègre l’IA dans un grand nombre de ses outils : 

• Rapprochement automatique ; 
• Suivi des approbations ; 
• Gestion des paiements fournisseurs ; 
• Recouvrements simplifiés. 

💸 Prix de Quadient : les tarifs ne sont pas divulgués publiquement. Vous devrez passer par la case “devis” pour en savoir plus. 

10) Yooz : une solution simple à prendre en main et immatriculée PDP par l’État

Comme les autres outils mentionnés dans ce guide, Yooz est conforme aux exigences de la facturation électronique obligatoire en France (loi de finances 2024-2026). 

Ce qui le distingue, c’est son rapport qualité-prix intéressant, son déploiement ultra-rapide et sa compatibilité avec plus de 250 ERP. Que vous utilisiez Sage, Cegid, inqom, ACD, Xero ou tout autre logiciel comptable, ce dernier sera compatible avec Yooz. 

Selon les avis clients, Yooz est également très intuitif et en phase avec les besoins des entrepreneurs. 

💸 Prix de Yooz : les tarifs débutent à partir de 99 € par mois pour les entreprises et 90 € par mois pour les cabinets comptables. Un essai gratuit de 15 jours vous est proposé. 

11) Open Bee : la plateforme GED conçue à votre image

Enfin, terminons notre sélection de logiciels pour la facturation électronique obligatoire avec Open Bee. Cette solution homologuée PDP par l’administration fiscale a été créée en 2008 à Annecy par Marc Balleydier. 

Depuis, elle perdure et se spécialise dans la gestion électronique de documents (GED) et la dématérialisation des processus métier. 

Voici les points forts de la solution PDP d’Open Bee : 

• Automatisation de la gestion des factures ; 
• Archivage sécurisé à long terme ; 
• Fonctionnalités analytiques avancées ; 
• Protocoles de sécurité avancés. 

Si vous avez besoin d’insights précis sur les flux de facturation de votre entreprise, Open Bee est donc une bonne option. 

💸 Prix d’Open Bee : les tarifs varient en fonction des fonctionnalités requises, du niveau de support et de formation nécessaire. Pour obtenir une estimation précise et adaptée à vos besoins spécifiques, nous vous recommandons de demander un devis. 

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Quels sont les prix des logiciels de facturation électronique ?

Nous vous conseillons évidemment de consulter notre article sur les prix des plateformes agréées pour en savoir plus mais sachez qu’il existe des logiciels à tous les prix de 0€ à plusieurs milliers d’euros par mois en fonction de la taille de votre entreprise.

Voici un tableau récapitulatif sur les tarifs des logiciels de facturation électronique :

Quel est le meilleur logiciel de facturation électronique ? 

Le meilleur logiciel dépendra de :

1. Votre profil
2. Votre besoin
3. Votre budget

Le meilleur conseil qu’on puisse vous donner est de regarder du côté de vos logiciels existants avant de jeter un oeil du côté des nouveaux logiciels.

Nous pouvons vous donner des recommandations en fonction des 3 critères indiqués ci-dessus mais il est impossible de décerner le titre de « meilleur logiciel pour la facturation électronique ».

Est-ce qu’un logiciel certifié plateforme agréée est obligatoire pour la facturation électronique ?

Et non.

Il y a parfois une confusion entre plateforme agréée (PA) et solution compatible (SC) qui vous permettent tous les deux d’être conforme pour la facturation électronique.

La différence entre une PA et une SC se situe dans le niveau d’habilitation auprès de l’état et le rôle technique dans la transmission des factures.

Une plateforme agréée est un acteur immatriculé et contrôlé directement par l’état qui peut recevoir et transmettre des factures électroniques directement à une autre PA.

Une SC est un logiciel de gestion, de facturation ou de caisse qui n’est pas immatriculé en tant que PA par l’État. Elle ne peux pas transmettre directement les factures à l’État mais elle passe elle-même par une PA.

Une solution compatible est un logiciel de certification qui n’a pas obtenu le statut de PA. Il doit donc lui-même passer par une PA pour être conforme avec la facturation électronique. De nombreux SC font le choix de ne pas devenir une PA pour éviter l’enfer administratif français.

Vous pouvez donc être conforme avec la facturation électronique en passant pas une SC ou solution compatible.

Comment choisir son logiciel de facturation électronique ? 

Maintenant que vous avez un aperçu des logiciels adaptés à la facturation électronique obligatoire, parlons des critères de choix. 

Pour sélectionner votre outil, vérifiez bien : 

• Que son nom figure dans la liste officielle des PA ; 
• Que ses fonctionnalités répondent à vos besoins ; 
• Que son prix entre dans votre budget. 

Une fois ces 3 cases cochées, vous pourrez vous rapprocher du prestataire en question pour demander un essai gratuit. 

Et maintenant, voici 13 modèles de factures à télécharger au format Word, Excel ou PDF.

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Amandine Dujardin

Content Manager

Rédactrice et Content Manager freelance, Amandine écrit du contenu qui convertit. Pas de blabla ni d’infos en trop, elle s’appuie sur des données fiables et des enquêtes sérieuses pour rédiger des articles de qualité, fidèles à la réalité.

Amandine est la créatrice du blog Passion Télétravail.

Ses trois logiciels préférés : Facture.net pour la facturation, Airtable pour la gestion de projet et WordPress.org pour la création de sites web.