Les 4 Meilleurs Experts-Comptables en ligne pour PME en 2025 : Le Comparatif Complet

Par Gatien Guemas | Le 26/08/2025

Si vous êtes une PME et que vous vous demandez comment faire le bon choix d’expert-comptable en ligne, vous êtes au bon endroit ! 

Jusqu’en 2025, la plupart des experts-comptables en ligne ne travaillaient qu’avec des entreprises en comptabilité de trésorerie (celles dont le chiffre d’affaires restait en dessous de certains seuils). C’était le seul type de comptabilité qu’on pouvait automatiser facilement. Aujourd’hui, les meilleurs experts-comptables en ligne accompagnent aussi les entreprises en comptabilité d’engagement, même quand leur chiffre d’affaires dépasse ces seuils.

Chez Tool Advisor, nous vous donnons nos meilleurs conseils pour faire le bon choix facilement et sans détour.

Après la lecture de cet article (donc dans même pas 8 minutes), vous saurez comment choisir un expert-comptable quand on est une PME, l’intérêt (ou non) de faire appel à un expert-comptable en ligne, le prix de ces derniers et notre sélection des 4 experts-comptables pour PME que nous recommandons le plus.

En bref :

Si vous avez la flemme de parcourir toute notre sélection, voici nos coups de ❤️ pour les PME :

• Dougs pour une solution complète et qualitative
• Keobiz pour les nombreuses offres et services complémentaires et le logiciel Pennylane
• Ça Compte Pour Moi pour l’accompagnement premium
• LegalPlace pour l’accompagnement global

Notre sélection de 4 experts-comptables en ligne pour PME

Chez Tool Advisor, nous accompagnons les entrepreneurs dans leurs choix de logiciels en ligne. Nous avons accompagné plus de 1000 professionnels dans leur choix d’expert-comptable en ligne, voici les 4 que nous recommandons le plus avec en bonus un aperçu sur le choix d’un cabinet d’expert-comptable traditionnel.

1. Dougs, une solution complète et qualitative pour les PME

Le cabinet Dougs est le leader de la comptabilité en ligne et un des experts-comptables en ligne que nous recommandons le plus. La startup propose une offre un Pack PME qui comprend un logiciel de comptabilité en ligne, un ensemble de prestations comptables, tout le nécessaire pour la facturation, ainsi que de l’accompagnement et du conseil sur-mesure et illimité. 

Dougs propose un excellent équilibre entre facilité d’utilisation de l’espace en ligne, qualité de l’accompagnement, ce qui selon nous peut justifier son prix plus élevé que celui de ses concurrents. 

2. Keobiz, l’expert-comptable en ligne pour les PME avec Pennylane

Comptant plus de 15 000 clients, Keobiz est considéré comme un des leaders de l’expertise-comptable en ligne. Fondée en 2012, l’entreprise propose une des offres les plus polyvalentes du marché à destination de nombreux profils d’entrepreneurs.

Keobiz est parvenu à combiner expert-comptabilité en ligne et expert-comptabilité traditionnelle, pour proposer les avantages de chaque approche. L’entreprise accorde une importance particulière à l’accompagnement et la mise à disposition d’outils digitaux pour améliorer les échanges entre les entrepreneurs et le cabinet.

En passant sur le logiciel Pennylane en 2022, Keobiz est passé au niveau supérieur au niveau de la technologie et se distingue comme un expert-comptable en ligne pointu et innovant.

3. Ça Compte Pour Moi pour les PME qui ont besoin d’un accompagnement avancé

Ça Compte Pour Moi figure également parmi les leaders du marché de l’expertise-comptable en ligne, grâce à une offre adaptée à tous les profils d’entrepreneurs, un accompagnement de qualité et un logiciel simple d’utilisation.

Les tarifs pour les PME peuvent varier selon la fourchette de votre chiffre d’affaires et peuvent donc être assez élevés, mais justifiés par la qualité d’accompagnement. Ça Compte Pour Moi affiche l’un des meilleurs niveaux de satisfaction client du marché, et représente une solution idéale pour les PME qui recherchent un accompagnement avancé.

4. LegalPlace pour les PME qui ont besoin d’un accompagnement global

LegalPlace s’est imposé comme leader de la création d’entreprise en ligne en France. La plateforme propose aujourd’hui un accompagnement complet pour les entrepreneurs : juridique, comptable, social, et même la domiciliation.

Sa particularité : LegalPlace est un des rares experts-comptables en ligne à proposer de l’accompagnement par un comptable dédié, en fonction de votre secteur d’activité.

Autre atout de LegalPlace : sa polyvalence, qui lui permet de couvrir la plupart des besoins juridiques. Un seul regret :un manque de transparence sur les prix, malheureusement.

5. Bonus : un expert-comptable traditionnel

Faire appel à un expert-comptable traditionnel reste une solution rassurante pour de nombreuses PME. Contrairement à un expert-comptable en ligne, la proximité géographique permet un contact direct, des échanges en personne et un accompagnement plus humain et personnalisé, notamment dans les phases clés de développement de l’entreprise.

Certains dirigeants de PME apprécient aussi la stabilité d’une relation de long terme avec un cabinet expert-comptable installé localement. En revanche, cette approche est un choix plus coûteux et moins souple en termes d’outils digitaux.

Pour les entreprises qui recherchent un accompagnement sur-mesure avec un contact direct, ça reste un choix pertinent.

Quel est le prix d’un expert-comptable pour PME ?

Ce qui fait varier le prix pour les PME

Côté tarifs, le prix d’un expert-comptable pour une PME dépend de plusieurs facteurs. La taille de l’entreprise, le volume de pièces à traiter, le type de comptabilité (trésorerie ou engagement), ou encore les besoins spécifiques (paie, conseil, juridique) peuvent considérablement faire varier la facture. Le niveau d’accompagnement attendu joue aussi un rôle important : un suivi régulier et personnalisé coûtera logiquement plus cher qu’une simple tenue comptable standard. Et bien sûr, les tarifs varient selon qu’il s’agit d’un expert-comptable en ligne ou traditionnel, dit “de proximité”, ce deuxième étant souvent plus cher.

Les tarifs des experts-comptables en ligne pour PME

Les cabinets d’experts-comptables en ligne proposent aujourd’hui des tarifs adaptés aux PME, souvent plus accessibles que ceux des cabinets traditionnels. Comme mentionné plus haut, les tarifs varient selon le niveau de service, le volume de documents à traiter, ou encore les options choisies (gestion de la paie, déclarations sociales, conseil, etc.). 

Keobiz affiche l’un des tarifs les plus accessibles, à partir de 79 € HT par mois, suivi de LegalPlace à 85 € HT/mois, puis Ça Compte Pour Moi dès 99 € HT/mois. Dougs, avec son pack PME à 159 € HT/mois, propose une offre très complète, pensée pour des entreprises en croissance ou ayant des besoins plus avancés. Ces montants restent indicatifs : ils varient selon l’activité, la structure juridique ou les attentes en matière d’accompagnement.

Si les cabinets d’experts-comptables en ligne peuvent proposer des tarifs avantageux, c’est notamment grâce à l’automatisation de nombreuses tâches comptables. Ils ont généralement l’avantage de présenter des forfaits clairs, ce qui permet aux PME de bien maîtriser leur budget.

Les tarifs des experts-comptables de proximité pour les PME

Comme mentionné précédemment, les tarifs d’experts-comptables de proximité sont généralement plus élevés que ceux des cabinets en ligne.

Pour une PME, il faut souvent compter entre 150 et 300 € HT par mois pour un accompagnement de base, mais les prix peuvent rapidement grimper selon le volume d’activité, la complexité des opérations ou les besoins en conseil.

Ce coût s’explique par un accompagnement plus personnalisé, des rendez-vous qui peuvent être fait en présentiel et une relation de proximité que n’offrent pas les cabinets d’experts comptables en ligne. Certains dirigeants de PME préfèrent donc ce modèle, surtout lorsqu’ils recherchent un suivi régulier et une relation de long terme avec leur expert-comptable.

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Comment choisir son expert-comptable quand on est une PME ?

Pour choisir votre expert-comptable, commencez par vous poser cette simple question : votre entreprise a-t-elle plutôt besoin d’un cabinet en ligne ou d’un expert-comptable de proximité ?

L’expertise-comptable en ligne peut convenir à de nombreuses PME, mais ce n’est pas forcément une solution universelle. Si votre activité est complexe, que vous avez un certain nombre de salariés, des opérations internationales ou des besoins très spécifiques en conseil, un cabinet de proximité peut s’avérer plus adapté. Aussi, si vous tenez à des échanges réguliers en présentiel ou si vous n’êtes pas à l’aise avec les outils digitaux, mieux vaut alors privilégier un expert-comptable de proximité.

En revanche, si vous êtes à l’aise avec le digital et que vous cherchez une solution simple, réactive et bien structurée, les cabinets d’experts-comptables en ligne peuvent vous faire gagner en efficacité tout en réduisant vos coûts.

Dans ce cas : 

• Regardez quel expert-comptable en ligne prend en charge votre activité ;
• Définissez précisément votre besoin pour évaluer le coût des prestations complémentaires ; 
• Comparez les devis détaillés des experts-comptables en ligne et arbitrez ;
• Et enfin, on dit ça juste comme ça, passez par notre Tool Advisor pour découvrir l’expert-comptable en ligne qui vous correspond le mieux.

Si vous avez besoin de conseils, n’hésitez pas à nous contacter, on répond en 24h max et après avoir analysé plus de 10 experts-comptables en ligne, on pense avoir une bonne vision du marché (ceci est un euphémisme).

Gatien Guemas

Fondateur de Tool Advisor

Ses trois logiciels préférés : Notion, Calendly pour prendre des rendez-vous et l’indispensable Suite Google.